Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTF1AQ7RTS3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms