Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms