Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA3Q53S33 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms