Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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