Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
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RTL8BQ17RB0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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RTL8BQ17RB0 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RTL8BQ17RB0 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
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RTL8BQ17RB0 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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