Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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