Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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SYCP1Q15431 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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SYCP1Q15431 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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SYCP1Q15431 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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SYCP1Q15431 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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SYCP1Q15431 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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SYCP1Q15431 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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SYCP1Q15431 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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SYCP1Q15431 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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