Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCOLCEQ15113 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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