Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA7Q13683 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms