Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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ITGB3BPQ13352 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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ITGB3BPQ13352 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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ITGB3BPQ13352 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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ITGB3BPQ13352 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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ITGB3BPQ13352 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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ITGB3BPQ13352 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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ITGB3BPQ13352 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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ITGB3BPQ13352 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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ITGB3BPQ13352 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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ITGB3BPQ13352 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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ITGB3BPQ13352 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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ITGB3BPQ13352 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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