Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
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