Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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FOXF1Q12946 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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FOXF1Q12946 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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FOXF1Q12946 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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FOXF1Q12946 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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FOXF1Q12946 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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FOXF1Q12946 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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FOXF1Q12946 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FOXF1Q12946 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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