Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PUDPQ08623 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PUDPQ08623 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PUDPQ08623 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PUDPQ08623 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PUDPQ08623 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PUDPQ08623 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PUDPQ08623 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PUDPQ08623 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PUDPQ08623 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PUDPQ08623 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PUDPQ08623 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PUDPQ08623 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PUDPQ08623 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PUDPQ08623 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms