Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL1Q08397 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms