Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CALD1Q05682 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms