Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRB1P82279 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRB1P82279 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRB1P82279 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CRB1P82279 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CRB1P82279 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CRB1P82279 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms