Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVS71-1P61550 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms