Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCCD1P59942 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms