Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPC3P51654 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPC3P51654 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms