Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASP4P49662 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP4P49662 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP4P49662 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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