Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RGRP47804 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RGRP47804 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RGRP47804 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RGRP47804 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RGRP47804 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RGRP47804 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RGRP47804 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms