Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TGFBR1P36897 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TGFBR1P36897 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms