Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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HOXA13P31271 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA13P31271 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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