Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLD1P28340 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLD1P28340 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLD1P28340 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms