Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRCP23327 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRCP23327 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRCP23327 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRCP23327 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms