Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC9A1P19634 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC9A1P19634 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms