Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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