Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EPCAMP16422 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms