Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AL513475.2-201ENST00000402316 392 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC025580.1-201ENST00000559553 729 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AL583859.2-201ENST00000634462 1127 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 HVCN1-209ENST00000620084 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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