Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PGA3P0DJD8 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms