Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms