Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CREB3O43889 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms