Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EBAG9O00559 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms