Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NEDD8-MDP1E9PL57 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NEDD8-MDP1E9PL57 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NEDD8-MDP1E9PL57 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NEDD8-MDP1E9PL57 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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NEDD8-MDP1E9PL57 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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NEDD8-MDP1E9PL57 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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NEDD8-MDP1E9PL57 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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