Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN25C9JDP6 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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