Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms