Protein–RNA interactions for Protein: U3KPZ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KPZ7 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KPZ7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KPZ7 Metazoa_SRP.125-201ENST00000618659 283 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KPZ7 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KPZ7 LINC01358-209ENST00000635072 1114 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KPZ7 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KPZ7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KPZ7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KPZ7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KPZ7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KPZ7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KPZ7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KPZ7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KPZ7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KPZ7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U3KPZ7 HYKK-205ENST00000566332 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AL627308.2-201ENST00000420014 432 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 HNRNPH3P1-201ENST00000431935 583 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 LINC01099-202ENST00000512527 578 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AL356800.1-201ENST00000553339 735 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AC139099.1-203ENST00000570366 607 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U3KPZ7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 TPT1P4-201ENST00000403538 519 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AL357060.2-201ENST00000440578 1025 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
U3KPZ7 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms