Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDY1Q9Y6F8 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms