Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PPARGC1AQ9UBK2 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms