Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TFIP11Q9UBB9 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms