Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 FAM209A-201ENST00000371328 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 CD226-207ENST00000582621 1458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 WFDC5-201ENST00000307971 1034 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC24A3Q9HC58 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC24A3Q9HC58 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC24A3Q9HC58 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC24A3Q9HC58 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC24A3Q9HC58 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC24A3Q9HC58 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC24A3Q9HC58 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC24A3Q9HC58 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC24A3Q9HC58 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC24A3Q9HC58 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC24A3Q9HC58 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC24A3Q9HC58 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms