Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC2Q9BYS8 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms