Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIFKQ9BYG3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms