Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SRRTQ9BXP5 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms