Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BBS2Q9BXC9 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms