Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP58Q9BVL2 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms