Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KATNB1Q9BVA0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms