Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FYCO1Q9BQS8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FYCO1Q9BQS8 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms