Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3AQ96ST3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms