Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK5RAP3Q96JB5 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms